第94天:数据分析之 pandas 初步

2019/12/20

by 轩辕御龙

数据分析之 pandas 初步

pandas是一个常用的第三方 Python 库,提供快速灵活的数据处理功能,也是进行数据分析的有力工具。我们的口号是:“更快,更高,更强”(皮一下)。啊,当然,现在经常有很多库一上来就要“吊打”pandas,咱们还是不必在意。

pandas尤其擅长处理以下数据:

以下几种数据尤其适合用pandas进行处理:

  • 多种数据混合的扁平化数据格式,比如 SQL 表和 Excel 电子表格;
  • 时间序列数据,不管有序无序;
  • 任意带有行列标签的矩阵数据,不管是同种数据类型还是多种数据类型;
  • 还有其他任意的统计数据集,不必带标签。

在本文开头要提醒的是,pandas指的不是英语中的“panda”,熊猫。实际上pandas是术语“panel data”(面板数据)的简写,大家要注意:这不是国宝模块哈哈,不要看到这个模块就想起憨憨的大熊猫啦~

1. pandas 安装

有了之前文章的铺垫,其实安装这个步骤大家应该已经很熟悉了,但是在这里依然要再叙述一遍。已经安装好的同学跳过就好。

由于pandas并非 Python 的内置模块,因此我们直接从 Python 官网下载安装的发行版是不包含 pandas这个模块的。这个时候你要是想import numpy,显然是会无功而返的。因此我们需要额外安装 pandas模块。

安装 pandas有好几种方式,我们这里推荐的是:1)使用pip进行安装;2)安装Anaconda

1.1 使用pip安装

这种方式推荐给已经从 Python 官网下载了某个 Python 发行版的读者,或是已经通过其它方式获得了 Python 环境,但却没有 pandas这个模块的读者。

安装命令:

pip install pandas

或:

python -m pip install pandas

均可。

当然,实际上 pandas模块本身也有很多依赖,也需要其他一些模块才能够真正发挥出它强大的功能,因此我们推荐一次安装多个模块:

python -m pip install --user numpy scipy matplotlib ipython jupyter pandas sympy nose

1.2 安装 Anaconda

这种方式适合还没有安装 Python 的读者,或是已经安装了 Python 但是想一劳永逸拥有大多数科学计算库的读者。

访问 Anaconda 官网找到下载链接进行安装即可。

或者如果你觉得 Anaconda 过于臃肿,也可以安装其简化版本 Miniconda

2. 主要数据类型

pandas中有两个主要的数据类型,一种是 Series,称为“序列”,是一种一维数据结构;另一种是 DataFrame,称为“数据帧”或是“数据框架”,是一种二维数据结构。在pandas中,我们就是使用这两种主要的数据结构,“喜迎四海宾朋,笑对八方来客”,分分钟处理掉天上地下来的各种数据。

其中,Series 内部要求是同种数据,而 DataFrame 则可以使混合数据。更进一步地说, DataFrame 其实就是包含了一至多个 Series

前面我们学习了numpy模块的基本相关知识,如果大家还有印象的话可以回忆一下。

numpy虽然提供了强大的多维数组供我们进行数据处理,但是这中间有一个要命的问题:维数比较少的时候还好,维数一旦多起来,你还分得清哪个轴代表什么意义吗?呃当然不排除有人可以,但是大多数人肯定是不行的,因为numpy的每个轴之间其实没有什么本质上的差异,你可以是轴 1,我也可以是轴 1,谁有比谁高贵怎么滴?因此在使用numpy进行高维数据处理,尤其是当其中每个维度都有特定的意义时,使用numpy的多维数组就会给使用者造成很大的负担——而这些本来不应该是由使用者负担的。

因此pandas的优势就体现出来了。pandas可以为每一列数据打上标签,这样通过标签就可以直接区分开每个轴谁是谁,也可以通过标签获得更具语义性的信息,知道每列数据都是什么、有什么用途。即使是交换了顺序也无所谓,比较在pandas中,我们可以不再以默认的序号作为索引。

当然pandas还有可以组合多种数据类型等优势,这些就留待大家在实践中体会啦~

我们预先导入pandas,并且由于演示过程中会用到numpy模块,在这里也一并导入:

import numpy as np
import pandas as pd

2.1 Series

Series 实际上是一个带标签的一维数组,数组中的内容可以是任何数据类型。在 Series 中,“带标签的轴”统称为“index(索引)”,类似于我们之前学习的字典数据类型中的“key(关键字)”。

2.1.1 创建 Series

创建 Series 最常用的方法就是调用pd.Series

>>> s = pd.Series(data, index=index)

其中,data要求是下列数据类型之一:

  • Python 字典;
  • Python 列表;
  • N 维数组;
  • 标量(即一个数字)。

而参数index则应当是一个用来指定轴标签的列表。

按照原始数据类型的不同,创建 Series 的方式也分为 4 种:1)用 Python 字典创建;2)用 Python 列表创建;3)用 N 维数组创建;4)用标量创建。

  1. Python 字典
>>> d = {'b': 1, 'a': 0, 'c': 2}
>>> s = pd.Series(d)
>>> s
b    1
a    0
c    2
dtype: int64
  1. Python 列表
>>> l = [1,2,3]
>>> s = pd.Series(l)
>>> s
0    1
1    2
2    3
dtype: int64

可以看到,在只使用列表而不提供索引值时,pandas会自动为 Series 中的数据分配默认索引作为标签。

  1. N 维数组
>>> ar = np.random.randn(5)
>>> ar
array([-0.12383463,  0.2312694 ,  1.82605315, -1.4743252 , -0.71267657])
>>> s = pd.Series(ar, index=['a', 'b', 'c', 'd', 'e'])
>>> s
a   -0.123835
b    0.231269
c    1.826053
d   -1.474325
e   -0.712677
dtype: float64
  1. 标量
>>> # 标量生成单元素序列
>>> s = pd.Series(5.)
>>> s
0    5.0
dtype: float64
>>> 
>>> # 标量生成多元素序列
>>> s = pd.Series(5., index=['a', 'b', 'c', 'd', 'e'])
>>> s
a    5.0
b    5.0
c    5.0
d    5.0
e    5.0
dtype: float64

2.1.2 索引 Series

既然说到 Series 类似于一维数组,也就是说 Series 也可以通过序号进行索引:

>>> s = pd.Series([5,-4,7,-8,9], index=['a','b','c','d','e'])
>>> s
a    5
b   -4
c    7
d   -8
e    9
dtype: int64
>>> s[2]
7
>>> s[1]
-4

其次,Series 还可以通过标签进行索引:

>>> s['a']
5
>>> s['d']
-8

并且 Series 也有切片功能:

>>> s[1:3]
b   -4
c    7
dtype: int64
>>> s[:3]
a    5
b   -4
c    7
dtype: int64

甚至标签也可以用于切片:

>>> s['a':'d']
a    5
b   -4
c    7
d   -8
dtype: int64

都是观察可以发现,使用标签进行索引与使用序号进行索引还是存在一点儿不同:使用序号进行索引时,切片结果不会包括结束序号对应的内容;但使用标签进行索引就会包括末尾标签指定的内容。

还可以从 Series 中直接选取特定的项。同样地,也是既可以使用序号,也可以使用标签,但要记得将指定的序号或标签放在一个列表中:

>>> # 使用序号
>>> s[[1,2]]
b   -4
c    7
dtype: int64
>>> 
>>> # 使用标签
>>> s[['a','d']]
a    5
d   -8
dtype: int64

此外还有根据条件进行筛选的用法,这种用法是一种pandasif-then方言:

>>> s[s > 0]
a    5
c    7
e    9
dtype: int64

这样就提取出了s中大于 0 的部分。

还要注意,Series 的直接赋值不会创建副本,如果想要新的 Series 对象与旧的没有关系,需要显式地创建副本并赋值:

>>> s2 = s
>>> s2 is s
True
>>> s2 = s.copy()
>>> s2 is s
False

2.1.3 Series 的运算

类似numpy数组地,Series 的算术运算——包括应用于很多numpy中的函数——也是逐元素进行的:

>>> s + s
a    10.0
b    -8.0
c    14.0
d   -16.0
e    18.0
dtype: float64
>>> s * 2
a    10.0
b    -8.0
c    14.0
d   -16.0
e    18.0
dtype: float64
>>> np.exp(s)
a     148.413159
b       0.018316
c    1096.633158
d       0.000335
e    8103.083928
dtype: float64

而 Series 与numpy数组的不同之处在于,Series 有自动对齐的特性,也就是说,在运算中如果两个参与运算的 Series 数据长度不一样,pandas会自动用默认的缺省值补全缺失的部分,以使运算顺利进行:

>>> s[1:] + s[:-1]
a     NaN
b    -8.0
c    14.0
d   -16.0
e     NaN
dtype: float64

简单来讲,在运算时如果遇到了“在某个运算对象中找不到对应项标签”的情况,那么pandas就会自作主张用缺省值NaN来代替。这就使得在进行交互式数据分析的时候有了极大的灵活性。

2.2 DataFrame

2.2.1 创建 DataFrame

DataFrame 是一种二维带标签的数据结构,并且允许各列直接数据类型不同。我们既可以把它当做是电子表格或是 SQL 表,也可以将其当作是一个由若干个 Series 对象组成的字典;也是pandas中最常用的数据结构。

创建 DataFrame 的方法是调用pd.DataFrame

pd.Series(data, index=index, columns=columns)

其中的data参数要求是下列数据类型之一:

  • 由一维数组、列表、字典或是 Series 构成的字典;
  • 二维 Numpy 数组;
  • 结构化数组;
  • 一个 Series;
  • 别的 DataFrame。

参数index对应于 DataFrame 中的行标签,参数columns对应于DataFrame 中的列标签。通过指定这两个参数,可以有筛选使用哪些数据来生成 DataFrame。

在这里我们仅仅介绍 3 中可能用到的方法。

  1. 使用由 Series 组成的字典由字典组成的的字典来创建 DataFrame

如果不指定columns参数的话,默认将columns设置为字典关键字的有序列表。

>>> d = {'one': pd.Series([1., 2., 3.], index=['a', 'b', 'c']),
...      'two': pd.Series([1., 2., 3., 4.], index=['a', 'b', 'c', 'd'])}
>>> df = pd.DataFrame(d, index=['d', 'b', 'a'])
>>> df
   one  two
d  NaN  4.0
b  2.0  2.0
a  1.0  1.0
>>> df = pd.DataFrame(d, index=['d', 'b', 'a'], columns=['two', 'three'])
>>> df
   two three
d  4.0   NaN
b  2.0   NaN
a  1.0   NaN
>>> 
>>> # 默认形式
>>> df = pd.DataFrame(d)
>>> df
   one  two
a  1.0  1.0
b  2.0  2.0
c  3.0  3.0
d  NaN  4.0
  1. 使用 N 维数组或列表的字典
>>> d = {'one': [1., 2., 3., 4.],
...      'two': [4., 3., 2., 1.]}
>>> pd.DataFrame(d)
   one  two
0  1.0  4.0
1  2.0  3.0
2  3.0  2.0
3  4.0  1.0
>>> pd.DataFrame(d, index=['a', 'b', 'c', 'd'])
   one  two
a  1.0  4.0
b  2.0  3.0
c  3.0  2.0
d  4.0  1.0
  1. 使用字典组成的列表
>>> data2 = [{'a': 1, 'b': 2}, {'a': 5, 'b': 10, 'c': 20}]
>>> pd.DataFrame(data2)
   a   b     c
0  1   2   NaN
1  5  10  20.0
>>> pd.DataFrame(data2, index=['first', 'second'])
        a   b     c
first   1   2   NaN
second  5  10  20.0
>>> pd.DataFrame(data2, columns=['a', 'b'])
   a   b
0  1   2
1  5  10

2.2.2 索引 DataFrame

通过indexcolumns两个属性可以分别查看 DataFrame 的行标签和列标签:

>>> d = {'one': pd.Series([1., 2., 3.], index=['a', 'b', 'c']),
...       'two': pd.Series([1., 2., 3., 4.], index=['a', 'b', 'c', 'd'])}
>>> df = pd.DataFrame(d)
>>> df
   one  two
a  1.0  1.0
b  2.0  2.0
c  3.0  3.0
d  NaN  4.0
>>> df.index
Index(['a', 'b', 'c', 'd'], dtype='object')
>>> df.columns
Index(['one', 'two'], dtype='object')

可以使用列标签来索引:

>>> df['one']
a    1.0
b    2.0
c    3.0
d    NaN
Name: one, dtype: float64

也可以直接将列标签作为属性:

>>> df.one
a    1.0
b    2.0
c    3.0
d    NaN
Name: one, dtype: float64

还可以按列选取:


>>> df[['one', 'two']]
   one  two
a  1.0  1.0
b  2.0  2.0
c  3.0  3.0
d  NaN  4.0

要对 DataFrame 按行索引,则需要使用loc这个属性:

>>> df.loc['a']
one    1.0
two    1.0
Name: a, dtype: float64

同样地,也可以通过行标签来按行切片、选取:

>>> df.loc['a':'c']
   one  two
a  1.0  1.0
b  2.0  2.0
c  3.0  3.0
>>> df.loc[['a','d']]
   one  two
a  1.0  1.0
d  NaN  4.0

此外,还可以使用headtail来分别获取数据的前、后几行,具体数目由参数指定:

>>> df.head(2)
   one  two
a  1.0  1.0
b  2.0  2.0
>>> df.tail(2)
   one  two
c  3.0  3.0
d  NaN  4.0

2.2.3 统计信息

使用describe可以计算得到一个 DataFrame 数据的相关统计信息,并且计算统计信息时会自动忽略缺省值NaN

>>> df
   one  two
a  1.0  1.0
b  2.0  2.0
c  3.0  3.0
d  NaN  4.0
>>> df.describe()
       one       two
count  3.0  4.000000
mean   2.0  2.500000
std    1.0  1.290994
min    1.0  1.000000
25%    1.5  1.750000
50%    2.0  2.500000
75%    2.5  3.250000
max    3.0  4.000000

其中count是各列的数据个数,mean是各列数据的平均值,std则对应标准差,后续的各行为从最小值到最大值的均匀数据。

还可以使用median方法主动求出平均值:

>>> df.median() # 也适用于 Series
one    2.0
two    2.5
dtype: float64

2.3 其他

Series 和 DataFrame 都可以使用同样的方法转换为numpy数组的形式:

>>> s.to_numpy()
array([ 5., -4.,  7., -8.,  9.])

此外,两种主要数据结构还有一个叫做apply的方法,用来对实例调用指定的函数。可以指定已有的函数,也可以临时定义一个匿名函数,后者更加常见一些:

>>> df.apply(len)
one    4
two    4
dtype: int64
>>> df.apply(lambda x: x * x)
   one   two
a  1.0   1.0
b  4.0   4.0
c  9.0   9.0
d  NaN  16.0

3. 读取数据

实际上,大多数时候我们并不会手动创建一个 Series 或是 DataFrame,更一般的方法是通过使用pandas的读写接口,直接从文件中读取需要处理的数据。

为了演示pandas读取数据的功能,我们提供了一个真实的数据集,其中包含加利福尼亚州住房数据。同学们可以从“代码示例”获取该文件;也可直接使用示例代码中指定的 URL 进行下载。

california_housing_dataframe = pd.read_csv("/data/california_housing_train.csv", sep=",")

使用columns来看看有哪些种类的数据:

>>> california_housing_dataframe.columns
Index(['longitude', 'latitude', 'housing_median_age', 'total_rooms',
       'total_bedrooms', 'population', 'households', 'median_income',
       'median_house_value'],
      dtype='object')

pandas提供了大量函数用于文件读写,适用于 CSV、Excel、HDF、SQL、JSON、HTML 等文件类型,还包括一个读取系统剪贴板的接口pd.read_clipboard()

4. pandas 画图

上一节我们读取了一个真实的数据集,现在让我们针对其中意义最丰富的属性median_house_value(即平均房价)这一列,来画个直方图瞧一瞧:

>>> import matplotlib.pyplot as plt
>>> california_housing_dataframe.hist('median_house_value')
array([[<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x00000222934BC8D0>]],
      dtype=object)
>>> plt.show()

加州平均房价直方图

然后我们使用latitude作为 x 轴,以latitude作为 y 轴,考察一下加州房价在南北走向上的分布:

>>> california_housing_dataframe.plot.scatter(y='median_house_value',x='latitude')
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x000002229301C7B8>
>>> plt.show()

加州房价南北分布

从图上我们可以看到,加州的房价在南北走向上有两个高价带。

再考察一下东西走向上的分布:

>>> california_housing_dataframe.plot.scatter(y='median_house_value',x='longitude')
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot object at 0x00000222939A87B8>
>>> plt.show()

加州房价东西分布

可以看到,加州房价在东西走向上也出现了两个高价带。显然加州高价房应该是集中在两个区域,我们可以通过对应的经纬度,找到这两个区域。

最后我们将经纬度分别作为 x、y 轴,将平均房价作为 z 轴画出一个三维图像,直观地观察一下:

>>> from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
>>> x = california_housing_dataframe['longitude']
>>> y = california_housing_dataframe['latitude']
>>> z = california_housing_dataframe['median_house_value']
>>> fig = plt.figure()
>>> ax = Axes3D(fig)
>>> ax.scatter(x,y,z)
<mpl_toolkits.mplot3d.art3d.Path3DCollection object at 0x00000222943317B8>
>>> plt.show()

加州房价平面分布

通过拖动 3D 图像转换视角,容易看出确实有两个区域集中分布着高价房。

5. 总结

本文初步介绍了pandas模块中最核心的两个数据类型:Series 和 DataFrame,以及它们的一些性质。

通过演示读取数据和使用pandas画图,我们熟悉了pandas的基本操作,也感受了一下数据可视化的效果。

示例代码:Python-100-days

参考资料

pandas 文档

Google colab - pandas 简介

python:利用pandas进行绘图(总结)基础篇


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